Acerca de la Plataforma
DiseasesMapMx es una iniciativa científica independiente orientada a la visualización, integración y exploración de información sobre vigilancia genómica y epidemiología molecular de patógenos porcinos en México. La plataforma integra metadatos genómicos, moleculares y epidemiológicos asociados con la circulación de PRRSV y PCV2, permitiendo explorar patrones espaciales, temporales y moleculares relevantes para la salud porcina y la vigilancia de enfermedades.
Investigador Científico, Fundador y Desarrollador Principal
Perfiles Académicos
Colaboración Científica y Técnica
José Francisco Rivera Benítez
Investigador y colaborador científico con experiencia en diagnóstico viral y molecular, así como en soporte técnico de laboratorio para actividades de investigación, vigilancia epidemiológica, detección y caracterización de enfermedades infecciosas en porcinos.
Investigador en el Instituto Nacional de Investigaciones Forestales, Agrícolas y Pecuarias (INIFAP), México, adscrito al Centro Nacional de Investigación Disciplinaria en Salud Animal e Inocuidad (CENID-SAI), sede Palo Alto.
Miembro de la Academia Mexicana de Ciencias, en reconocimiento a sus contribuciones científicas en virología veterinaria.
Perfiles Académicos
Colaboración Institucional y Atribución de Datos
DiseasesMapMx es una iniciativa científica independiente desarrollada para fines de investigación, académicos, informativos y de visualización científica. Integra información genómica disponible públicamente y metadatos epidemiológicos asociados con actividades de investigación y vigilancia de patógenos porcinos en México.
La colaboración de campo, las actividades de laboratorio y los procesos de generación de datos han involucrado instituciones, investigadores y actores vinculados con la salud porcina. Las afiliaciones se presentan con fines de atribución científica y reconocimiento de colaboración y no implican que DiseasesMapMx constituya un sistema institucional oficial.
Cómo Usar el Tablero
El tablero está diseñado para la visualización exploratoria de metadatos moleculares curados y no identificantes. Sus mapas, gráficas y tablas son resúmenes descriptivos y no estimaciones oficiales de prevalencia, incidencia o estatus sanitario a nivel de granja.
- Seleccionar. Elija el patógeno o grupo de registros de interés.
- Filtrar. Restrinja la vista por año, región, etapa productiva, gen o linaje.
- Explorar. Revise mapas, indicadores, patrones temporales y resúmenes moleculares.
- Contextualizar. Use tablas y enlaces a GenBank para revisar el contexto de cada registro.
- Interpretar. Considere los patrones como evidencia exploratoria para análisis posteriores.
Acerca del Módulo de Análisis de Secuencias
El módulo de PRRSV-2 ORF5 realiza un tamizaje preliminar por referencia cercana contra un panel curado. No es un reporte diagnóstico ni una asignación filogenética formal; su interpretación requiere revisión de calidad, contexto del panel de referencia, análisis filogenético, información epidemiológica y criterio experto.
- Entrada. Proporcione una secuencia ORF5 de PRRSV-2 en FASTA o nucleótidos crudos.
- Validar. Revise caracteres, longitud, cobertura y el umbral de baja identidad.
- Tamizar. Compare la consulta contra señales de referencias curadas cercanas.
- Contextualizar. Revise el árbol maestro y las diferencias de aminoácidos en GP5.
- Revisar. Interprete científicamente; los envíos autorizados permanecen privados salvo liberación deliberada.
Arquitectura de la Plataforma y Motor de Análisis
DiseasesMapMx separa su interfaz web pública del motor analítico. La capa pública permite visualizar información, capturar solicitudes y mostrar resultados, mientras los servicios analíticos controlados realizan validación, procesamiento, consultas contra referencias curadas y devolución estructurada de resultados.
